Når der sker en hurtig ændring i en muskel, sender nerverne en besked til hjernen om at der foregår noget uvant. Det udløser en beskyttelses refleks i hjernen, der får musklen til at trække sig sammen. Samtidig sendes et signal til antagonisten (den modsatte muskel), om at denne skal slappe af.
Smerte Refleks Terapi går ud på at udnytte denne refleks, så man kan fjerne smerterne i musklerne. Dette kan gøres ved enten at bruge en reflekshammer, ved at bruge hurtige ryk fra terapeuten, eller ved at bruge en kombination af disse teknikker.